Hay varios secretos y objetos escondidos a lo largo de Cave Story 3D, empezamos con la gorra de Prinny. Hay que ir al cuarto donde conocemos al pescador mimiga. Hay una puerta secreta que lleva a una zona nueva donde está la gorra.
En el Laberinto, no hables con el profesor Booster, salta desde la marca roja y no agarres el Booster. Cuanto termines el camino del acueducto obtendrás el Booster 2.0 que es mucho más poderoso.
La Estrella Polar del principio del juego puede ser cambiada, en diferentes momentos, por tres armas distintas: Ametralladora, cerca de la mitad del juego, hablando con Curly. Spur, útil hasta la zona del Campo Sagrado, se consigue arriba de la aldea Mimiga hablando con el Hermitaño Herrero. La Serpiente, arma ideal para el Campo Sagrado, se consigue hablando con Chaba y cambiando la Estrella Polar y una bola de fuego.
Código: 15595 Plataforma: 3DS
